1. KEGG

现在自己用到的KEGG数据库主要是功能注释，下面谈一下我再用KEGG 时候的经验吧。
首先在kaas上传数据做基因的注释。
我们用的是prokka注释过后的faa文件：是蛋白序列。
当然基因序列也可以。

在这里插入图片描述

kaas 比对网站

https://www.genome.jp/tools/kaas/

在这里插入图片描述

得到的结果会在kaas的网站：
在这里插入图片描述
上面图片的text文件是下面的内容：
在这里插入图片描述
打开html之后内容就是：
在这里插入图片描述
代谢通路图（ko）：
在这里插入图片描述
K号信息：
在这里插入图片描述

另外在kobas上可以做kegg富集分析
https://www.jianshu.com/p/1b05500e4983 （可参考这个网站）

总觉得自己写的有很多偏差，心静不下来，就写的很不好。
但是坚持下去吧！ 加油。。。

# big data # html
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