下面内容摘录自《用R探索医药数据科学》专栏文章的部分内容。栏目后续章节的文章将深入概括R语言在临床研究和新药创新领域的应用,填补了国内R教材中尚未广泛覆盖的部分内容。

2章10节:用 R 直接下载并分析 NHANES 数据库的数据,文末示例自创便捷下载函数(更新20240807)_nhanes数据分析-CSDN博客文章浏览阅读680次。在临床研究领域,数据分析属于极为关键的一个环节。不过,众多临床医师在数据获取方面遭遇诸多难题,往往由于缺乏可供研究的数据,或者数据获取成本过高,从而难以展开深入的研究工作。伴随科技的不断进步,临床公共数据库的应运而生为研究者带来了全新的解决途径,使他们得以摆脱这一困局。与此同时,NHANES 是公共数据挖掘中极为重要的数据库,本文通过举例阐述如何用 R 来分析 NHANES 数据库。_nhanes数据分析https://blog.csdn.net/2301_79425796/article/details/140699707?csdn_share_tail=%7B%22type%22%3A%22blog%22%2C%22rType%22%3A%22article%22%2C%22rId%22%3A%22140699707%22%2C%22source%22%3A%222301_79425796%22%7D

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一、认识临床公共数据库和NAHENS

临床公共数据库是指由政府机构、学术机构、医院或其他组织收集并公开发布的临床数据集合。这些数据库通常包含了大量的患者信息、医疗记录、实验数据等,供研究者免费下载或付费使用。临床公共数据库的出现具有以下几方面的意义:

降低数据获取成本:传统的临床数据获取方式包括自行收集患者数据、与其他医疗机构合作等,耗时耗力且成本高昂。临床公共数据库的出现大大降低了数据获取的成本,使得研究者可以将更多资源投入到数据分析和研究本身。

增加数据可得性:临床公共数据库通常包含大量的多样化数据,包括不同地区、不同种族、不同病种的患者数据,增加了研究者获取数据的广度和深度,有助于提高研究的代表性和科学性。

促进科研合作:临床公共数据库为研究者提供了一个共享数据的平台,促进了不同机构、不同领域的科研人员之间的合作与交流,有助于多学科交叉研究的发展。

NHANES数据库

美国健康和营养检查调查(National Health and Nutrition Examination Survey,NHANES)乃是一项致力于对美国成年人群体以及儿童群体的健康与营养状况予以评估的研究规划。此调查由国家卫生统计中心(NCHS,其作为疾病控制与预防中心(CDC)的一部分,承担着为国家提供生命和健康统计数据的职责)牵头主导,是一项持续开展的健康状况调研。其官网(NHANES - National Health and Nutrition Examination Survey Homepage)归属于美国疾病控制与预防中心。

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在这里,你学到的并非仅仅是 R 的某一个技巧,而是能够从零开始,深入且系统地学习 R 语言。此外,本专栏每周至少定期更新三篇文章,每篇文章篇幅均在 5000 字以上,质量平均分更是高达 93 分。而且,对于已经发表的知识点,我们也会根据新的技术或理解及时进行更新,这是纸质版图书无法做到的。为了让更多的忠实粉丝和同学们享受到实惠,本专栏采用折扣定价策略。随着章节的不断完成,折扣力度会逐渐减小。所以,现在正是订阅的最佳时机!

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第一章:认识数据科学和R

1章1节:数据科学的发展历程,何 R 备受青睐及我们专栏的独特之处(更新20240822)-CSDN博客

1章2节:关于人工智能、机器学习、统计学连和机器学习、R 与 ChatGPT 的探究 (更新20240814)-CSDN博客

1章3节:R 语言的产生与发展轨迹(更新2024/08/14)-CSDN博客

1章4节:数据可视化, R 语言的静态绘图和 Shiny 的交互可视化演示(更新20240814)-CSDN博客

第二章:R的安装和数据读取

2章1节:R和RStudio的下载和安装(Windows 和 Mac)_rst语言选择哪个镜像-CSDN博客

2章2节:RStudio 四大区应用全解,兼谈 R 的代码规范与相关文件展示_rstudio的console和terminal-CSDN博客

2章3节:RStudio的高效使用技巧,自定义RStudio环境(更新20240823)_rstudio如何使用-CSDN博客

2章4节:用RStudio做项目管理,静态图和动态图的演示,感受ggplot2的魅力-CSDN博客

2章5节:认识和安装R的扩展包,什么是模糊搜索安装,工作目录和空间的区别与设置(​​​​​​​更新20240807 )-CSDN博客

2章6节:R的数据集读取和利用,如何高效地直接复制黏贴数据到R(​​​​​​​更新20240807 )_r语言 复制数据集-CSDN博客

2章7节:读写RDS,CSV,TXT,Excel,SPSS、SAS、Stata、Minitab等的数据文件(更新20240807)_r语言读取rds文件-CSDN博客

2章8节:一文学会 R Markdown 的文档核心操作,切记文末有R资源的分享_r markdown文件(.rmd)-CSDN博客

2章9节:认识R与数据库连接和网络爬虫,学会在R中使用SQL语言_sql和r语言-CSDN博客

2章10节:用 R 直接下载并分析 NHANES 数据库的数据,文末示例自创便捷下载函数(更新20240807)_nhanes数据分析-CSDN博客

第三章:认识数据

3章1节:数据的基本概念以及 R 中的数据结构、向量与矩阵的创建及运算-CSDN博客

3章2节:继续讲R的数据结构,数组、数据框和列表-CSDN博客

3章3节:R的赋值操作与算术运算_r里面的赋值-CSDN博客

3章4节:R的逻辑运算和矩阵运算-CSDN博客

3章5节:R 语言的循环与遍历函数全解析-CSDN博客

第四章:数据的预处理

4章1节:全面了解 R 中的数据预处理,通过 R 基本函数实施数据查阅_r数据预处理-CSDN博客

4章2节:从排序到分组和筛选,通过 R 的 dplyr 扩展包来操作-CSDN博客

4章3节:处理医学类原始数据的重要技巧,R语言中的宽长数据转换,tidyr包的使用指南-CSDN博客

4章4节:临床数据科学中如何用R来进行缺失值的处理_临床生存分析缺失值r语言-CSDN博客

4章5节:数据科学中的缺失值的处理,删除和填补的选择,K最近邻填补法-CSDN博客

4章6节:R的多重填补法中随机回归填补法的应用,MICE包的实际应用和统计与可视化评估-CSDN博客

4章7节:用R做数据重塑,数据去重和数据的匹配-CSDN博客

4章8节:用R做数据重塑,行列命名和数据类型转换-CSDN博客

4章9节:用R做数据重塑,增加变量和赋值修改,和mutate()函数的复杂用法_r语言如何在数据集中添加变量-CSDN博客

4章10节:用R做数据重塑,变体函数应用详解和可视化的数据预处理介绍-CSDN博客

4章11节:用R做数据重塑,数据的特征缩放和特征可视化-CSDN博客

4章12节:R语言中字符串的处理,正则表达式的基础要点和特殊字符-CSDN博客

4章13节:R语言中Stringr扩展包进行字符串的查阅、大小转换和排序-CSDN博客

4章14节:R语言中字符串的处理,提取替换,分割连接和填充插值_r语言替换字符串-CSDN博客

4章15节:字符串处理,提取匹配的相关操作扩展,和Stringr包不同函数的重点介绍和举例-CSDN博客

4章16节:R 语言中日期时间数据的关键处理要点_r语言 时刻数据-CSDN博客

第五章:定量数据的统计描述

5章1节:用R语言进行定量数据的统计描述,文末有众数的自定义函数-CSDN博客

5章2节:离散趋势的描述,文末1个简单函数同时搞定20个结果-CSDN博客

5章3节:在R语言中,从实际应用的角度认识假设检验-CSDN博客

5章4节:从R语言的角度认识正态分布与正态性检验-CSDN博客

5章5节:认识方差和方差齐性检验(三种方法全覆盖)-CSDN博客

5章6节:R语言中的t检验,独立样本的t检验-CSDN博客

5章7节:单样本t检验和配对t检验-CSDN博客

5章8节:方差分析(ANOVA)及其应用-CSDN博客

5章9节:组间差异的非参数检验,Wilcoxon秩和检验和Kruskal-Wallis检验-CSDN博客

第六章:定性数据的统计描述 

6章1节:定性数据的统计描述之列联表,文末有优势比计算介绍-CSDN博客

6章2节:认识birthwt数据集,EpiDisplay和Gmodels扩展包的应用-CSDN博客

6章3节:独立性检验,卡方检验,费希尔精确概率检验和Cochran-Mantel-Haenszel检验-CSDN博客​​​​​​​

6章4节:相关关系和连续型变量的Pearson相关分析-CSDN博客​​​​​​​

6章5节:分类型变量的Spearman相关分析,偏相关分析和相关图分析-CSDN博客

6章6节:相关图的GGally扩展包,和制表的Tableone扩展包-CSDN博客​​​​​​​

第七章:R的传统绘图

​​​​​​​7章1节:认识R的传统绘图系统,深度解析plot()函数和par()函数的使用-CSDN博客

7章2节:R基础绘图之散点图、直方图和概率密度图-CSDN博客

7章3节:R基础绘图之条形图和堆积条形图-CSDN博客

7章4节:饼图,箱线图和克利夫兰点图-CSDN博客

7章5节:散点矩阵图,与小提琴图、Cleveland 点图、马赛克图和等高图-CSDN博客

7章6节:用R进行图形的保存与导出,详细的高级图形输出,一文囊括大多数保存的各种问题,和如何批量保存不同情况的图形-CSDN博客

第八章:R的进阶绘图

8章1节:认识 ggplot2 扩展包,深度解析 qplot() 函数的使用-CSDN博客

 8章2节:深度讲解 ggplot2 的绘图步骤,理解其核心逻辑, 和 ggplot()函数-CSDN博客

 8章3节:用R来绘制医学地理图,文末有具体完整代码-CSDN博客

 8章4节:维恩图的认识与应用,和使用UpSet图-CSDN博客

 8章5节:用R绘制平行坐标图-CSDN博客​​​​​​​

8章6节:雷达图及RadViz图-CSDN博客

8章7节:词云图,矩形树状图和三维散点图-CSDN博客

 ​​​​​​​8章8节:绘制自定义的高质量动态图和交互式动态图-CSDN博客

第九章:临床试验的统计

9章1节:初步认识临床试验(约7500字)-CSDN博客

9章2节:样本量估计的初步介绍-CSDN博客

9章3节:用R进行样本量估计的统计学参数-CSDN博客

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