miRTarBase:miRNA-靶标互作数据库
你还不知道吧,miRNA与其靶基因的互作(MTI)已成为药物开发的主流方向
MicroRNA (miRNA) 是一类长度约为22个核苷酸的非编码单链RNA分子,它们通过与靶mRNA配对以调节基因表达,并在各种生理和病理过程中产生显着变化。近年来,miRNA与其靶基因的互作(MTI)已成为药物开发的主流方向。miRTarBase作为一个miRNA-靶标互作的数据库,前后经历了五次修改和增强。2022年更新版的数据库可访问地址:https://miRTarBase.cuhk.edu.cn/。
更新版数据库包括从13389篇文章和 CLIP-seq 数据中积累的220万个经实验验证的MTI。采用优化的评分系统,增强本次更新对 MTI 相关文章和相应疾病信息的识别。整合了胞外囊泡、血液和不同组织的 miRNA 表达谱,包括外泌体miRNA和组织特异性miRNA,以探索 miRNA 功能和生物标志物。
表 miRTarBase 9.0改进和新增
对于用户界面,开发者对与 miRNA 作用相关的各种验证实验进行了分类,包括 RNA 表达、特异性相互作用、蛋白质表达和生物学功能。
图 miRTarBase的新增界面
总之,最新版的miRTarBase包含最全面且经过实验验证的注释,用户界面也更加友好,是研究MTI的最佳选择。
参考文献
miRTarBase update 2022: an informative resource for experimentally validated miRNA–target interactions. Nucleic Acids Research, 2021.
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