Brain Network Transformer 使用指南
Brain Network Transformer 使用指南BrainNetworkTransformerThe open-source implementation of the NeurIPS 2022 paper Brain Network Transformer....
Brain Network Transformer 使用指南
1. 目录结构及介绍
本项目是基于NeurIPS 2022论文的开源实现,用于脑网络分析的Transformer模型。下面是该仓库的基本目录结构及其简要说明:
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source
: 核心源代码所在目录,包含模型训练和评估的主要脚本。__init__.py
: 确保目录作为Python包导入。- 包含其他.py文件,具体负责模型定义、数据处理等。
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conf
: 配置文件夹,存放所有相关的配置项。dataset
**: 存放特定于数据集的配置文件,如ABIDE.yaml,用于指定数据路径和其他数据相关参数。
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LICENSE
: 许可证文件,说明了该项目的使用权限。 -
.gitignore
: Git忽略文件,指定不应纳入版本控制的文件或目录。 -
README.md
: 此文档,提供了关于项目快速概览和基本使用方法的信息。 -
paper.pdf
(假设存在,但未在原始引用中明确给出): 可能包含了论文的PDF文件,供查阅详细研究背景和理论。
2. 项目的启动文件介绍
启动项目主要通过命令行进行。核心的启动脚本可以通过以下命令执行:
python -m source --multirun datasz=100p
该命令调用了source
目录下的入口点,其中--multirun
参数可能指示支持不同的运行配置或实验设置,而datasz=100p
则可能是指定了数据集的一个大小或预处理参数。具体参数含义需参考源码中的帮助文档或配置文件解释。
3. 项目的配置文件介绍
配置文件主要位于conf
目录下,特别是子目录dataset
内的文件,比如ABIDE.yaml
。这些YAML文件定义了必要的环境变量和设置,以确保项目能够正确指向数据集,并且可以调整特定的实验设置。一个典型的配置文件可能会包含以下几个关键部分:
- 数据路径 (
path
): 指向下载的ABIDE数据集的本地存储位置。 - 数据预处理选项: 如数据分割方式、标准化方法等。
- 模型训练参数: 可能包括批次大小、学习率、训练轮数等。
- 网络架构配置: 若配置文件涉及,它将定义模型的一些超参数。
为了调整项目的行为,用户应编辑相应的配置文件来匹配他们的硬件资源和实验需求。务必参照项目文档或源码注释来理解每个配置项的具体作用。
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