分析SEER数据库一个套路!本周这几篇统计学方法大差不差
欢迎报名郑老师团队零基础NHANES培训课程!培训 | 全套课程,立即可看!NHANES数据库挖掘课,永久回放SEER(The Surveillance, Epidemiology, and End Results)数据库是由美国国立癌症研究所于 1973 年建立,是美国常用的癌症数据库,里面包括了各式各样的肿瘤类型,如肺癌、乳腺癌、胃癌等;还提供了各式各样的临床资料,如性别、年龄、TNM 分期等
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SEER(The Surveillance, Epidemiology, and End Results)数据库是由美国国立癌症研究所于 1973 年建立,是美国常用的癌症数据库,里面包括了各式各样的肿瘤类型,如肺癌、乳腺癌、胃癌等;还提供了各式各样的临床资料,如性别、年龄、TNM 分期等。
一、本周SEER文献预览
本周PubMed数据库“标题/摘要:SEER”搜索发现,本周发表11篇SEER论文,其中共2篇医学1区,1篇医学2区文章,部分文章介绍如下。
部分高分论文列表如下:
1.外国学者文章介绍(一)
标题:基于人群的美国癌症患者COVID-19死亡风险研究
背景:在这项研究中,我们提供了迄今为止最大规模的美国癌症队列分析,以表征COVID-19的死亡。
数据来源:从美国国家癌症研究所(National cancer Institute)的监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库中提取2020年15个亚型的4020669例癌症患者。
方法: 从美国国家癌症研究所(National cancer Institute)的监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库中提取2020年15个亚型的4020669例癌症患者。我们使用cox比例风险模型调查COVID-19死亡的预后因素,并计算风险比(HR)。标准化死亡率(SMRs)使用SEER观察到的死亡率计数和基于美国死亡率的预期死亡率计算。
结果:291323例患者死亡,其中14821例(5.1%)死于COVID-19感染。COVID-19疾病特异性死亡率为11.81/10,000人年,SMR为2.30 (95% CI: 2.26-2.34, p < 0.0001)。在26种非癌症死亡原因中,COVID-19是仅次于缺血性心脏病(5.2%)的第二大死亡原因。年龄较大(80岁以上vs < =49岁:HR 21.47, 95% CI: 19.34-23.83)、男性(vs女性:HR 1.46, 95% CI: 1.40-1.51)、未婚(vs已婚:HR 1.47, 95% CI: 1.42-1.53)、西班牙裔或非西班牙裔美国人(vs非西班牙裔白人:HR 2.04, 95% CI: 1.94-2.14和HR 2.03, 95% CI: 1.94-2.14)的患者COVID-19死亡风险最高。
结论:我们观察到,癌症患者死于COVID-19的风险是美国普通人群的两倍。这项工作可被医生和公共卫生官员用于制定幸存者计划,以降低COVID-19死亡风险。
2.中国学者文章介绍(二)
标题:比较T1a实性肾肿块局部肿瘤破坏、局部肿瘤切除和部分肾切除术的肿瘤预后:来自SEER数据库的一项基于人群的队列研究
背景:很少有大规模的分析比较局部肿瘤破坏(LTD)或局部肿瘤去核/切除(LTE)相对于部分肾切除术(PN)对T1a肾肿块患者的癌症特异性生存(CSS)和总生存(OS)。我们的目的是比较CSS和OS后LTD、LTE和PN。
数据来源:在监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库(2000-2019)中,我们确定了临床T1a肾肿块和组织学证实的肾癌患者。
方法:在监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库(2000-2019)中,我们确定了临床T1a肾肿块和组织学证实的肾癌患者,这些患者接受了LTD、LTE或PN治疗。经1:1比例倾向评分匹配(PSM)后,进行组间比较。Kaplan-Meier分析和log-rank检验用于比较匹配人群的生存率。
结果:在3717例LTD患者与1993例LTE患者和26935例PN患者的总队列中,77.3%的LTD治疗患者和74.4%的LTE治疗患者年龄超过60岁,而只有50.3%的PN治疗患者年龄超过60岁。不仅在PSM队列中,而且在肿瘤大小≤3 cm和肿瘤大小为3.1 ~ 4 cm的患者亚组中,PN与CSS(风险比(HR)=1.276, P<0.001)和OS (HR=1.112, P<0.001)的相关性高于LTD,而PN与CSS (HR=1.040, P=0.230)和OS (HR=0.888, P=0.002)的相关性低于LTE。
结论:在临床T1a实性肾肿块患者中,与LTE和PN相比,LTD的CSS和OS较低,而LTE与肿瘤大小无关,其CSS和OS均优于PN。
3.中国学者文章介绍(三)
标题:直径为5-10 cm的胃肠道间质瘤的内镜治疗与手术治疗的长期生存结果比较
背景:目前,内镜下治疗胃肠道间质瘤(GIST)已被广泛接受。然而,对于大于5cm的肿瘤,由于对安全性和不良肿瘤结局的担忧,内镜治疗尚未被国家指南认可为标准治疗。因此,本研究比较了5-10 cm间质瘤内镜治疗和手术治疗的长期生存结果。
数据库:从2004年至2015年的监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库中选择GIST患者。
方法:我们从2004年至2015年的监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库中选择GIST患者。采用Kaplan-Meier分析和log-rank检验比较内镜治疗和手术治疗的长期生存结果。采用多因素Cox比例风险模型分析影响患者预后的危险因素。
结果:为了平衡基线数据,我们进行了1:1的倾向评分匹配(PSM)。共纳入1223例GIST患者,其中144例(11.8%)接受内镜治疗,1079例(88.2%)接受手术治疗。PSM治疗前,两组患者的长期生存率无显著差异[5年OS (86.5% vs. 83.5%, P = 0.42), 10年OS (70.4% vs. 66.7%, P = 0.42)]。调整协变量后,我们发现内镜治疗组和手术治疗组的总生存(HR = 1.26, 95% CI 0.89-1.77, P = 0.19)和癌症特异性生存(HR = 1.69, 95% CI 0.99-2.89, P = 0.053)风险具有可比性。在PSM后的分析中,内镜治疗组与手术治疗组之间无显著差异。
结论:我们的研究发现,对于肿瘤大小在5 - 10 cm之间的GIST患者,内镜治疗组和手术治疗组的长期OS和CSS结果相似。
4.中国学者文章介绍(四)
标题:三阴性乳腺癌患者肝转移的预后模型:一项基于人群的研究
背景:TNBC患者的肝转移(LM)与显著的发病率和死亡率相关。本研究的目的是建立一个临床模型来预测TNBC-LM患者的生存。
目的:然而,由于缺乏预测三阴性乳腺癌肝转移(TNBC-LM)患者生存的工具,临床医生仍然难以建立预后分层和治疗策略。基于大量人群的临床数据,我们开发了一个敏感且有鉴别性的列线图,并验证了它可以在初诊或后期预测TNBC合并LM患者的预后。
数据库:临床病理资料从监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库和中山大学第五附属医院(FAFSYU)检索。
方法:临床病理资料从监测、流行病学和最终结果(SEER)数据库和中山大学第五附属医院(FAFSYU)检索。基于SEER数据库中新诊断的具有LM的TNBC患者(nTNBC-LM),建立并验证了一种预测性列线图。通过招募FAFSYU的晚期发生LM的TNBC患者,其对晚期病程中TNBC患者LM的预测作用。进一步评估不同治疗方法对nTNBC-LM的预后影响。
结果:建立并验证了预测TNBC-LM患者预后的预后模型。对于初诊或治疗后期诊断的LM患者,列线图的C指数(训练组、验证组和扩展组分别为0.712、0.803和0.699)和校准图显示出可接受的预后准确性和临床适用性。原发肿瘤的手术切除和化疗被发现与更好的总生存期(OS)显著相关。
结论:建立了一个敏感和判别的模型来预测TNBC-LM患者在初诊时和初诊后的OS。
5.中国学者文章介绍(五)
标题:成人肾上腺皮质癌患者治愈阈值时肿瘤大小的估计:一项基于人群的研究
背景:肿瘤大小对肾上腺皮质癌(ACC)患者预后的意义尚未得到充分评估。我们的目的是研究肿瘤大小对成年ACC患者预后价值的影响。
数据来源:采用监测、流行病学和最终结果计划(SEER)对2004 - 2015年确诊的成年ACC患者进行分析。
方法: 采用监测、流行病学和最终结果计划(SEER)对2004 - 2015年确诊的成年ACC患者进行分析。“X-Tile”程序确定肿瘤大小的最佳截止值。评估癌症特异性生存期(CSS)和总生存期(OS)。生存结局和危险因素分别采用Kaplan-Meier法和多变量Cox回归分析。
结果:共纳入426例成人ACC患者。单变量和多变量Cox分析显示,年龄、较大肿瘤大小和转移是降低CSS和OS的一致预测因素。采用X-tile软件确定肿瘤大小的最佳截断值为8.5 cm, Kaplan-Meier方法显示较大肿瘤(>8.5 cm)和较小肿瘤(≤8.5 cm)患者的预后差异显著(log-rank检验,P < 0.001)。亚组分析显示,在所有8个预先指定的亚组中,肿瘤大小对CSS和OS的比例影响没有统计学意义。有趣的是,另一个亚组分析显示ACC患者在CSS和OS方面不能从化疗中获益。
结论:本研究提示肿瘤大小是ACC患者预后的重要因素,8.5 cm的临界值可能提示预后不良。鉴于现有数据的局限性,最终确定不同肿瘤大小范围的成年ACC患者化疗的益处是具有挑战性的。
更多文章如下:
外国学者:
中国学者:
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