一、前言

部分新手直接化用代码跑出来的图很多都是典型红蓝分组或者黄绿，可视化图第一目的是反馈数据信息，再者第二目的是让人看的明白看的舒服，ggsci很好的针对于可视化时的颜色问题。

这是ggsci包官网里面的一句话：

My eyes were finally opened and I understood nature.
I learned at the same time to love it.
— Claude Monet

二、官方教程

ggsci的调色板常用的来自于期刊，可视化数据库，电影电视节目等（并非全部都是期刊，上次一位学生逮着问辛普森是什么期刊）。每个调色板是有颜色可修改线框或填充颜色：

scale_color_palname()
scale_fill_palname()

Name	Scales	Palette Types	Palette Generator
NPG	scale_color_npg() scale_fill_npg()	“nrc”	pal_npg()
AAAS	scale_color_aaas() scale_fill_aaas()	“default”	pal_aaas()
NEJM	scale_color_nejm() scale_fill_nejm()	“default”	pal_nejm()
Lancet	scale_color_lancet() scale_fill_lancet()	“lanonc”	pal_lancet()
JAMA	scale_color_jama() scale_fill_jama()	“default”	pal_jama()
JCO	scale_color_jco() scale_fill_jco()	“default”	pal_jco()
UCSCGB	scale_color_ucscgb() scale_fill_ucscgb()	“default”	pal_ucscgb()
D3	scale_color_d3() scale_fill_d3()	“category10” “category20” “category20b” “category20c”	pal_d3()
LocusZoom	scale_color_locuszoom() scale_fill_locuszoom()	“default”	pal_locuszoom()
IGV	scale_color_igv() scale_fill_igv()	“default” “alternating”	pal_igv()
UChicago	scale_color_uchicago() scale_fill_uchicago()	“default” “light” “dark”	pal_uchicago()
Star Trek	scale_color_startrek() scale_fill_startrek()	“uniform”	pal_startrek()
Tron Legacy	scale_color_tron() scale_fill_tron()	“legacy”	pal_tron()
Futurama	scale_color_futurama() scale_fill_futurama()	“planetexpress”	pal_futurama()
Rick and Morty	scale_color_rickandmorty() scale_fill_rickandmorty()	“schwifty”	pal_rickandmorty()
The Simpsons	scale_color_simpsons() scale_fill_simpsons()	“springfield”	pal_simpsons()
GSEA	scale_color_gsea()	scale_fill_gsea() “default”	pal_gsea()
Material Design	scale_color_material() scale_fill_material()	“red” “pink” “purple” “deep-purple” “indigo” “blue” “light-blue” “cyan” “teal” “green” “light-green” “lime” “yellow” “amber” “orange” “deep-orange” “brown” “grey” “blue-grey”	pal_material()

#展示颜色
install.packages("scales")
library("scales")
library("ggsci")
color= pal_npg("nrc")(10) #以npg为例，其他同理
show_col(color, 
         labels = T, 
         cex_label = 0.8, 
         ncol = NULL)

2.1 NPG

（Nature Publishing Group）

color= pal_npg("nrc")(10)

2.2 AAAS

（American Association for the Advancement of Science）

color= pal_aaas("default")(10)

2.3 NEJM

（New England Journal of Medicine）

color= pal_nejm("default")(8)

2.4 Lancet

（柳叶刀）

color= pal_lancet("lanonc")(9)

2.5 JAMA

（The Journal of the American Medical Association）

color= pal_jama("default")(7)

2.6 JCO

（Journal of Clinical Oncology）

color= pal_jco("default")(10)

2.7 UCSCGB

（UCSC数据库）

color= pal_ucscgb("default")(26)

2.8 d3

（JavaScript绘图库D3.js色板）

color= pal_d3("category10")(10) #category20，category20b，category20c

2.9 locuszoom

（locuszoom网站）

color= pal_locuszoom("default")(7)

2.10 igv

（igv基因组染色体查看器）

color= pal_igv("default")(51)
color= pal_igv("alternating")(2)

2.11 uchicago

（芝加哥大学）

color= pal_uchicago("default")(9) #light，dark

2.12 startrek

（星际迷航）

color= pal_startrek("uniform")(7)

2.13 tron

（创战纪）

color= pal_tron("legacy")(7)

2.14 futurama

（futurama节目）

color= pal_futurama("planetexpress")(12)

2.15 rickandmorty

（rick and morty节目）

color= pal_rickandmorty("schwifty")(12)

2.16 simpsons

（辛普森一家）

color= pal_simpsons("springfield")(16)

2.17 gsea

（gsea常规配色）

color= pal_gsea("default")(12)

2.18 material

（单色板）

color= pal_material("red")(10) #单色，根据上述色更换即可

三、讨论

上述所有颜色直接使用即可，线框可正常调节粗细之类的。此外还可各自自由搭配，摆脱最原始的审美疲劳配色!

#调节透明度
show_col(pal_nejm("default", alpha = 0.6)(8))
show_col(pal_nejm("default", alpha = 0.9)(8))