geo差异表达分析_GEO数据分析差异表达基因
近些年来AI、深度学习、神经网络、5G等黑科技深入人心,这或多或少得益于大数据的发展。在医学领域,也有大数据的应用,比如IBM的Watson医生等,GWAS分析,精准医疗,23andMe基因组检测等。自2003年人类基因组计划的完成(斥资30亿美元,平均一个碱基对1美元),经过近20年的发展,人类全基因组测序低至2000RMB,如果通过芯片进行基因检测,成本更低。生物学研...
近些年来AI、深度学习、神经网络、5G等黑科技深入人心,这或多或少得益于大数据的发展。在医学领域,也有大数据的应用,比如IBM的Watson医生等,GWAS分析,精准医疗,23andMe基因组检测等。自2003年人类基因组计划的完成(斥资30亿美元,平均一个碱基对1美元),经过近20年的发展,人类全基因组测序低至2000RMB,如果通过芯片进行基因检测,成本更低。

生物学研究和基础医学的发展密切相关,传统医学的发展,离不开基础生物学的研究。随着科学技术的进步,大量的生物信息学数据迸发,各种各样的数据库涌现(NCBI,ENSEMBL,UCSC属于生物信息的综合性数据库),传统的医学统计分析手段,很难对大量的数据进行挖掘了。其中NCBI中的GEO数据,NIH的TCGA数据库等,收录了大量基因测序数据和芯片数据,贯穿各种疾病的研究。为了利用如此庞大的数据,随之而来的就是生物信息的快速发展。与其他分析模块并行,这里我也慢慢开始讲述一些生物信息学在医学研究中的应用。

这是系列教程的一部分,采用的数据集是GEO数据库中的GSE121248,鉴于设计的内容太多,这里直接给出了操作视频,约23分钟。
分析结果


微信后台回复”GEO差异分析“,获取视频中代码和数据的下载链接。
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