酸解离常数(pKₐ)是衡量化合物电离能力的关键参数,在药物研发及各类化学工业中具有至关重要的作用。然而,通过实验测定 pKₐ(尤其是精确到原子层面的微观 pKₐ)不仅过程繁琐且耗时极长。因此,开发快速且高精度的 pKₐ 预测工具已成为行业内的迫切需求。

Graph-pKa 的核心优势

SciMiner团队成员曾构建了一个包含 16,595 个化合物及 17,489 个 pKₐ 值的数据库。基于此数据,团队此前开发了名为 Graph-pKa 的基于多实例学习与图神经网络的pKa预测模型(Bioinformatics, Volume 38, Issue 3, February 2022, Pages 792–798),其亮点包括:

● 卓越的预测精度:在测试集上,宏观 pKₐ 预测的平均绝对误差(MAE)约 0.55,决定系数(R^2)达到 0.92。

● 微观解离分析:结合多实例学习(Multi-instance Learning),Graph-pKa 能够自动将预测的宏观 pKₐ 解构为离散的微观 pKₐ 值,实现原子级的精准洞察。

工具升级与在线体验

我们现已完成算法升级并引入了更多训练数据!升级版的 Graph-pKa 已正式上线 SciMiner 平台。在 SciMiner Graph-pKa 的预测结果中,我们不仅标注了酸性和碱性的关键 pKₐ 值,更重要的是,系统还会自动检索并展示数据库中结构相似的分子及其实验测定的 pKₐ 真实值,为您的研究提供直观的参照。

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