GEPIA (Gene Expression Profiling Interactive Analysis) web服务器是2017年推出的，是基于TCGA和GTEx数据库中肿瘤和正常样本进行基因表达分析的一个资源。今天向大家介绍一下更新和增强的GEPIA2版本，提供了更高的resolution和更多的功能。

 

 

 

数据库介绍

 

GEPIA2具有198 619种isoforms（功能上相似的蛋白质，具有相似但不完全相同的氨基酸序列，由不同基因编码，或由去除不同外显子的相同基因的RNA转录本编码）和84种癌症亚型，从基因水平扩展到转录本水平将基因表达量化，支持对特定癌症亚型的分析和亚型之间的比较。此外，GEPIA2采用了受单细胞测序研究启发的新的基因特征量化分析技术，提供定制分析，用户可以上传自己的RNA-seq数据，并与TCGA和GTEx样本进行比较。还提供了一个用于批量处理的API，以及容易检索分析结果。更新后的web服务器可以通过（见文末）公开访问。

 

使用方法

 

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